Tập đoàn đã đầu tư hiện đại hóa các cảng xuất than (Cửa Ông, KM6, Làng Khánh, Bến Cân...) kết hợp với đầu tư các tuyến băng tải thay thế ô tô vận chuyển than ra cảng. Cụ thể, Năm 2016, tại Cẩm Phả, TKV đã đầu tư 651 tỷ đồng, hoàn thành hệ thống băng tải than Lép Mỹ - Cảng Km 6 dài hơn 4,5 km, công suất 720 tấn/giờ, chấm dứt vận chuyển than bằng ô-tô, mang lại hiệu quả kinh tế cao. Hiện nay, tại Uông Bí, hệ thống băng tải vận chuyển than Khe Ngát - Cảng Điền Công cũng đang được gấp rút hoàn thiện, dự kiến sẽ chính thức khánh thành và đi vào vận hành dịp 12/11/2017 - chào mừng kỷ niệm 81 năm Ngày Truyền thống công nhân Vùng Mỏ - Truyền thống Ngành Than. Hệ thống có tổng mức đầu tư hơn 1.291 tỷ đồng, dài gần 8 km, công suất vận chuyển 6 triệu tấn than/năm. Đây là dự án trọng điểm có ý nghĩa quan trọng đối với sản xuất và môi trường của TKV.

Than Hà Lầm được biết tới là đơn vị tiên phong trong công tác cơ giới hóa, hiện đại hóa sản xuất của TK. Cùng với việc đẩy mạnh nâng cao hiệu quả trong sản xuất kinh doanh, nỗ lực đầu tư và ứng dụng công nghệ khai thác tiên tiến, bám sát chủ trương, chiến lược của Tập đoàn công nghiệp Than - Khoáng sản Việt Nam về hiện đại hóa các mỏ than hầm lò,phấn đấu xây dựng:“Mỏ hiện đại - mỏ xanh, sạch, đẹp - mỏ an toàn - mỏ ít người”,Công ty cổ phần than Hà Lầm đã có nhiều giải pháp nhằm từng bước khắc phục, xử lý và bảo vệ môi trường, do đó môi trường sinh thái tại nơi khai thác cũng như địa bàn dân cư lân cận từng bước được cải thiện, đáp ứng mục tiêu phát triển sản xuất kinh doanh bền vững.

Trong tháng 10/2017, Công ty CP Than Hà Lầm đưa Hệ thống xử lý nước thải hầm lò công suất 4.000m³/giờ tại mặt bằng Sân công nghiệp +75 vào hoạt động. Với diện tích 7.500m², Hệ thống xử lý nước thải hầm lò này được đầu tư xây dựng để phục vụ việc xử lý toàn bộ nước thải hầm lò thuộc dự án“Đầu tư xây dựng công trình khai thác phần dưới mức -50mỏ than Hà Lầm - Công ty Than Hà Lầm”.Công trình được khởi công xây dựng từ tháng 5/2016 và hiện đã đi vào hoạt động ổn định, thiết bị của các nước tiên tiến như Đức, Ý, Trung Quốc; hệ thống được kiểm soát và điều kiển tự động qua hệ thống máy tính điều khiển tập trung, các số liệu được theo dõi và giám sát tự động.Chất lượng nước của hệ thống sau xử lý đảm bảo quy chuẩn cho phép (QCVN 40:2011/BTNMT) để tái sử dụng phục vụ sản xuất.

Công ty Than Nam Mẫu cũng là một trong những đơn vị tiêu biểu của TKV đã chủ động đầu tư ứng dụng khoa học công nghệ cho công tác môi trường.

Cùng với việc thực hiện tốt trách nhiệm và nghĩa vụ của doanh nghiệp với cơ quan quản lý nhà nước, Công ty Than Nam Mẫu đã mạnh tay đầu tư nhằm cơ giới hoá các khâu đảm bảo vệ sinh môi trường làm việc.Công ty đã đầu tư nhiều hệ thống hiện đại như: Đầu tư hơn 400 tỷ thay thế cột chống lò bằng gố bằng vì chống thuỷ lực nhằm giảm thiểu lượng gỗ chống lò góp phần bảo vệ rừng; Đầu tư hệ thống băng tải để vận chuyển than dài hơn 5Km từ nhà sàng +130 Than Thùng sang kho than Khe Thần - Vàng Danh trị giá hơn 350 tỷ đồng nhằm giảm thiểu chi phí vận chuyển đồng thời chấm dứt tình trạng phát tán bụi gây ô nhiễm môi trường trong hoạt động vận chuyển than…

Tại hệ thống vận chuyển và các kho than Công ty đã cho lắp đặt hệ thống “phun sương dập bụi” (là sự kết hợp hỗn hợp của khí nén và nước để tạo sương để dập bụi), nước được phun vào không khí dưới dạng sương giúp dập bụi phát tán trong quá trình vận chuyển và lưu trữ than đồng thời làm mát không khí mà không gây lầy lội đường, các hệ thống được vận hành liên tục trong 3 ca giúp cải thiện môi trường không khí, môi trường lao động cho người công nhân yên tâm sản xuất.